L'ADAPEI coopère avec de nombreuses structures associatives offrant une gamme de services complémentaires de ceux apportés dans ses établissements et services.

A ce titre, elle a notamment signé une convention de partenariat où elle est directement associée avec : les PEP (Pupilles Enseignement Public), le Centre Hospitalier des Pyrénées, l’AGEFIPH (Association Nationale de Gestion des Fonds pour l'Insertion Professionnelle des Personnes Handicapées), l’ANPE (Agence Nationale Pour l'Emploi), et l’OGEFA (Organisme de Gestion des Foyers Amitié).

Association de Défense et de Soutien des Handicapés (ADSH de l'ADAPEI)
Cette association gère une partie du patrimoine immobilier de l'ADAPEI.

Association de gestion de la résidence l'Esquirette
L'ADAPEI s'est associée à la Mairie de Lescar pour la création et la gestion de la Maison de Retraite de Lescar.

Comité d'Insertion des Personnes Handicapées (CIPH)
Il gère le service Cap Emploi Béarn, qui a pour mission l'accompagnement et le placement en milieu ordinaire de travail des personnes handicapées.

Association Départementale de Tutelle des Majeurs Protégés (ADTMP)
Elle a pour mission de veiller aux intérêts des majeurs protégés qui lui sont confiés.

Association Sportive et Culturelle : " Les Chamois Pyrénéens "
L'ADAPEI a fondé cette association afin de proposer des activités socio-éducatives et culturelles, des activités sportives et des séjours de vacances.

Association pour la Guidance Parentale et Infantile (AGPI)
L'ADAPEI est adhérente à l'AGPI. Elle confie à cet organisme qui travaille étroitement avec le Centre d'Action Médico-Sociale Précoce (CAMSP) le soin d'aider les familles des tous petits enfants quelle que soit la nature du handicap. L'AGPI est un lieu d'écoute, de conseils et de réconfort pour les parents.

Espoir 64
Section Départementale de l'UNAFAM (Union Nationale des Amis et Familles d'Adultes Malades Mentaux) a pour mission l'accompagnement d'adultes relevant d'un handicap psychique.

Le Carrefour des Associations
Instance informelle fédérant la plupart des associations du département intervenant dans les champs sociaux et médico-sociaux. Le Carrefour des Associations rassemblent administrateurs et directeurs d’association. C’est un lieu de réflexion, d’information et de formation sur les grands dossiers qui intéressent notre secteur. L’ADAPEI assure le secrétariat de cette organisation.

Centre d'Action Médico-Sociale Précoce (CAMSP)
Le CAMSP est un établissement de prévention et de soins pour les enfants âgés de 0 à 6 ans atteints d'un handicap mental, moteur ou sensoriel. Son équipe (médecins, paramédicaux, professionnels des secteurs social et éducatif) va conduire l'enfant au maximum de ses potentialités. Une aide à l'adaptation sociale et éducative des enfants dans leurs lieux de vie (halte garderie, crèche, maternelle…) est aussi procurée.

Association pour le Développement de l'Emploi Protégé (ADEP)
L'ADEP a pour but la création d'emplois protégés destinés à des personnes handicapées. Pour répondre à ses objectifs, l'association a créé un atelier protégé axé sur une activité de restauration : cafétéria “La Jardinière”, rue de Craonne à Pau.

Centres de formation de la région
Parmi lesquels nous pouvons citer : le CHP (Centre Hospitalier des Pyrénées), l’ITS (Institut de Travail Social) et l’AFMR (Association pour la Formation en Milieu Rural) d’Etcharry et les centres de formation d’apprentis.